ومع قبول المحكمة النظر في تلك القضية فإنها ستبدأ في محاكمة شخصيات إسرائيلية شغلت مناصب قيادية في تلك الفترة، من بينهم رئيس الأركان العامة "جابي أشكينازي" وقائد القوات البحرية "إيلي ماروم" إضافة إلى قائد القوات الجوية ومدير المخابرات الإسرائيلية.
وتتضمن لائحة الاتهام الشروع بالقتل العمد، والتسبب بالضرر الجسدي، ومصادرة حرية الأفراد بالإكراه، ومنع التواصل بين المدنيين، إضافة إلى تهم النهب وإلحاق الضرر بممتلكات الغير، وقد طالب الادعاء في هذه القضية بحبس المتهمين مددا يتجاوز مجموعها 18 ألف عام.
يذكر أن سفينة مرمرة الزرقاء كانت تحمل مساعدات إنسانية لسكان قطاع غزة المحاصرين منذ أكثر من 5 أعوام، وقد قتل في ذلك الهجوم 9 مدنيين أتراك وجرح أكثر من 50 آخرين.